Cá sấu Mỹ, được các nhà khoa học gọi là Alligator mississippiensis, đứng đầu chuỗi thức ăn. Được gọi là kẻ săn mồi đỉnh cao, cá sấu Mỹ trưởng thành ăn hầu như mọi sinh vật khác có chung môi trường sống, nhưng chúng không sợ gì ngoại trừ con người và những con cá sấu lớn hơn. Tuy nhiên, những con non của nó không an toàn lắm, và nhiều cá sấu con bị nhiều loại động vật ăn thịt dưới nước ăn thịt.
Cá và rùa là những con mồi quan trọng nhất đối với hầu hết các loài cá sấu, nhưng chúng không kén ăn. Các loài săn mồi phổ biến khác bao gồm rắn, ếch, cóc, kỳ nhông, chim, thằn lằn, hải ly, gấu trúc, nutria, chuột, động vật giáp xác, nhuyễn thể, côn trùng và cá sấu nhỏ hơn. Cá sấu con ăn những con mồi nhỏ hơn, bao gồm côn trùng, ếch và cá. Cá sấu ở mọi lứa tuổi đều thích nghi với các nguồn thức ăn địa phương, nhưng chúng là loài ăn thịt và không ăn thực vật.
Chim lội nước, rắn, cá lớn, rùa, gấu trúc, cáo và cá sấu lớn hơn săn cá sấu con. Khi chúng lớn lên, những con cá sấu non ngày càng thêm nhiều con mồi lớn hơn vào danh sách thức ăn có thể chấp nhận được của chúng. Đồng thời, cá sấu sợ ít kẻ săn mồi hơn khi chúng lớn lên.
Cá sấu là một phần quan trọng của hệ sinh thái nước ngọt vì chúng giúp duy trì sự cân bằng giữa các quần thể động vật nhỏ. Ngoài ra, rùa và một số động vật khác gửi trứng vào tổ cá sấu.
