Chế độ ăn điển hình của chim cánh cụt hoàng đế bao gồm cá, nhuyễn thể, mực và động vật giáp xác, mặc dù thành phần thực tế trong chế độ ăn của chúng khác nhau tùy từng quần thể. Cá là nguồn thức ăn quan trọng nhất đối với chim cánh cụt hoàng đế, với cá bạc Nam Cực chiếm phần lớn trong khẩu phần ăn của chim cánh cụt.
Mực băng, mực móc câu và loài nhuyễn thể Nam Cực cũng bị chim cánh cụt hoàng đế ăn, mặc dù với số lượng ít hơn. Những con chim cánh cụt này có thể bơi đến độ sâu hơn 1.755 feet để tìm thức ăn.
Chim cánh cụt hoàng đế được tìm thấy ở Nam Cực và thực sự sống trên các sông băng ở Nam Cực và trong các vùng nước lạnh giá xung quanh. Chúng tập trung lại với nhau để bảo tồn nhiệt và tránh xa những cơn gió lạnh.