Mắt mèo chảy nước do kích ứng mắt, các vấn đề về thoát nước mắt hoặc rối loạn về mắt. Sẹo do mèo đánh nhau, hình dạng khuôn mặt phẳng và ngắn cũng như tắc nghẽn do có cỏ, chất tiết hoặc bụi bẩn là những nguyên nhân khác nguyên nhân khiến mèo chảy nước mắt. Khi nước đặc hoặc dính với dịch tiết, có khả năng bị nhiễm trùng hệ hô hấp trên, đặc biệt khi kèm theo chảy nước mũi.
Để xác định nguyên nhân gây chảy nước, bác sĩ thú y nhỏ thuốc nhuộm huỳnh quang vào mắt mèo. Khi thuốc nhuộm đi đến lỗ mũi mèo một cách sạch sẽ, không có hiện tượng tắc nghẽn. Khi thuốc nhuộm không xuất hiện trong lỗ mũi, lỗ mũi đó là bên bị tắc nghẽn. Các tắc nghẽn được xử lý bằng kỹ thuật xả nước giúp loại bỏ chất gây ô nhiễm.
Giải pháp chữa chảy nước mắt cho mèo có thể đơn giản là cắt tỉa lông quanh mặt mèo, đây là giải pháp thích hợp khi lông dài gây cay mắt. Hầu hết các vấn đề về chảy nước mắt ở mèo do nhiễm trùng có thể được giải quyết bằng một liều kháng sinh phổ rộng dành cho động vật. Khi bị nhiễm trùng, thuốc kháng sinh thường được kê đơn trong ba tuần. Mèo mang thai và mèo con không được dùng thuốc mà không có sự chấp thuận của bác sĩ thú y.