Hai cấu trúc tế bào được tìm thấy trong tế bào động vật nhưng không có trong tế bào thực vật là tâm thể và lysosome. Centrosome là trung tâm tổ chức vi ống của tế bào, tạo ra thoi phân bào. Lysosome là hệ thống tiêu hủy tế bào, phá vỡ các vật liệu không mong muốn ra khỏi tế bào chất.
Tế bào động vật và thực vật đều là tế bào nhân thực, có nghĩa là chúng chứa nhân và các bào quan có màng bao bọc khác. Tuy nhiên, có một số điểm khác biệt giữa cấu trúc tế bào thực vật và động vật: tế bào thực vật có thành tế bào cứng và lục lạp; tế bào động vật có trung thể và lysosome.
Các cấu trúc tế bào độc đáo có trong tế bào động vật không làm cho động vật khác biệt rõ ràng với thực vật. Liệu một tế bào có cần thiết phải có một nhân trung hay không vẫn chưa được biết, vì các tế bào bị loại bỏ nhân tâm vẫn có thể trải qua quá trình nguyên phân và nguyên phân. Chức năng xử lý chất thải của lysosome trong tế bào động vật được thực hiện bởi không bào trong tế bào thực vật.
Ngược lại, các cấu trúc độc đáo có trong tế bào thực vật làm cho thực vật khác biệt hẳn với động vật. Thành tế bào làm cho tế bào thực vật trở nên cứng cáp và tạo cho thực vật khả năng phát triển cao hơn nhiều so với động vật ở môi trường trên cạn. Lục lạp cho phép thực vật thu nhận năng lượng từ mặt trời và chuyển hóa năng lượng đó thành carbohydrate thông qua quá trình quang hợp. Động vật không thể lấy năng lượng từ mặt trời và do đó phải tiêu thụ thực vật để lấy nguồn carbohydrate.
