Bò sát sống chủ yếu ở vùng khí hậu ôn đới và nhiệt đới. Bò sát là loài máu lạnh, có nghĩa là chúng không có khả năng điều chỉnh nhiệt độ bên trong cơ thể. Do đó, chúng phải sống ở những nơi có khí hậu ấm áp và đầy nắng.
Loài bò sát thích sống ở những vùng khí hậu khô và ấm hơn là những nơi ẩm ướt. Chúng có nhiều nhất ở các khu vực như sa mạc và bán sa mạc. Tuy nhiên, loài bò sát có thể được tìm thấy ở mọi lục địa, ngoại trừ Nam Cực. Các loài bò sát đã thích nghi để sống trong nhiều môi trường khác nhau, bao gồm nước, sa mạc, rừng rậm, rừng và núi. Các loài bò sát sống trong nước có thể làm như vậy tạm thời hoặc vĩnh viễn, tùy thuộc vào loài. Tuy nhiên, loài bò sát không giống như cá và không thể thở trong nước.
Trong khi loài bò sát có thể sống ở hầu hết mọi nơi, một số loài cụ thể chỉ có thể sống ở một số khu vực nhất định. Ví dụ, Quái vật Gila, là một trong hai loài thằn lằn có nọc độc, sống ở các vùng khô hạn và bán khô hạn của Hoa Kỳ và Mexico, nhưng môi trường sống của nó đang bị đe dọa do sự phát triển đô thị.
Các loài bò sát khác nhau có xu hướng sống ở các khu vực khác nhau. Ví dụ, rùa và một số loài rắn sống trong nước, trong khi một số loài bò sát như Thằn lằn râu Mexico có thể phát triển mạnh ở sa mạc Mexico. Cá sấu được tìm thấy chủ yếu ở các vùng cận nhiệt đới. Rắn là loài phổ biến nhất, rắn sống ở hầu hết các loại môi trường sống trên khắp thế giới.