Tài nguyên thiên nhiên của Missouri bao gồm chì, kẽm, quặng sắt, dolomit, barit, đá vôi, đồng, đá granit, đá cẩm thạch, sa thạch, đất cho các hoạt động nông nghiệp và nhiều hồ và sông. Missouri sản xuất 90% chì không quay vòng ở Hoa Kỳ, kể từ tháng 8 năm 2014. Các sản phẩm nông nghiệp bao gồm đậu nành, ngô, cỏ khô, gia súc, gà tây và gà.
Missouri có hơn 300 mỏ, chịu trách nhiệm cho hoạt động kinh tế trị giá 8 tỷ đô la, tính đến tháng 8 năm 2014. Các mỏ ở Missouri sử dụng hơn 30.000 người. Missouri là bang sản xuất chì hàng đầu, và 80% lượng chì được khai thác ở Missouri được đưa vào pin ô tô. Missouri cũng là nhà sản xuất vôi số một của Hoa Kỳ, phần lớn trong số đó đi vào sản xuất xi măng. Bang Show-Me đứng thứ ba về kẽm, thứ năm về đồng và thứ sáu về khai thác bạc trong tất cả 50 bang.
Đường thủy Missouri bao gồm các sông như Missouri, Mississippi, Platte, Osage, Meramec, Gasconade, St. Francis và Current. Các hồ lớn nhất trong bang, tất cả đều là nhân tạo, bao gồm Hồ of the Ozarks, Table Rock, Stockton và Bull Shoals.
Các loài cá chính trong các hồ và sông của bang bao gồm cá da trơn, cá hồi, cá vược, crappie, walleye và perch. Loài cá nhỏ nhất ở Missouri có kích thước nhỏ nhất là 1,5 inch và loài lớn nhất là cá mái chèo khổng lồ nặng hơn 100 pound.