Theo Bảo tàng Cổ sinh vật học của Đại học California, những khác biệt chính về hình thái giữa hoa một lá mầm và hoa một lá mầm bao gồm số lượng lá mầm, cấu trúc phấn hoa, số bộ phận hoa, gân lá, sự sắp xếp mạch máu của thân, sự phát triển của rễ và sinh trưởng thứ cấp. Cơ sở thực tế để phân biệt hai lớp thực vật hạt kín là số lượng lá mầm trong phôi.
Các lá mầm hút chất dinh dưỡng từ hạt cho đến khi hạt có khả năng tạo ra những chiếc lá thật đầu tiên và bắt đầu quang hợp. Hầu hết các dicots là hậu duệ của một loài thực vật đã phát triển ba rãnh hoặc lỗ chân lông trong phấn hoa của nó, được gọi là ba lỗ. Mặt khác, monocots có một hạt phấn với một rãnh đơn hoặc lỗ thông qua lớp ngoài, được gọi là monosulcate. Số lượng các bộ phận của hoa một lá mầm thường chia hết cho ba, trong khi hoa hai lá mầm có các bộ phận là bội số của bốn hoặc năm.
Bảo tàng Cổ sinh vật học của Đại học California chỉ ra rằng một số gân lá chính chạy song song dọc theo chiều dài của lá ở dạng lá đơn tính. Các lá mầm có các bó mạch sắp xếp bên trong thân cây tạo thành hình trụ và xuất hiện như một vòng đốm khi hoa cắt ngang thân cây. Cây đơn tính có các bó mạch trông rải rác khắp thân cây.