Sắc ký được sử dụng trong các quy trình công nghiệp để tinh chế hóa chất, kiểm tra lượng vết của các chất, các hợp chất không đối xứng riêng biệt và các sản phẩm thử nghiệm để kiểm tra chất lượng. Sắc ký là quá trình vật lý trong đó các hỗn hợp phức tạp được phân tách hoặc phân tích . Điều này được thực hiện bằng cách xả các chất khác nhau với tốc độ khác nhau dựa trên sự hấp thụ vào các môi trường khác nhau.
Phương pháp sắc ký phân tách và phân tích các chất phụ gia, vitamin, chất bảo quản, axit amin và protein trong thực phẩm để xác định hàm lượng dinh dưỡng. Phương pháp sắc ký có thể phát hiện aflatoxin, một chất gây ung thư có trong nấm mốc phát triển trên đậu phộng.Một ứng dụng rộng rãi của sắc ký là để phát hiện sự hiện diện của rượu trong máu. Quá trình này cũng lọc thuốc trong nước tiểu và các chất lỏng khác của cơ thể. Về phương diện khoa học pháp y, phương pháp sắc ký có thể phát hiện các lượng nhỏ hóa chất trong chất gia tốc hoặc chất nổ.
Ngành công nghiệp dược phẩm đã tìm ra cách để tách các hợp chất bất đối bằng sắc ký, như Bách khoa toàn thư mô tả. Thalidomide là một ví dụ về hợp chất bất đối với hai đồng phân giống hệt nhau về mọi mặt ngoại trừ sự liên kết của các phân tử. Một chất đồng phân gây ra dị tật bẩm sinh và chất đồng phân kia có thể được sử dụng để điều trị vi khuẩn kháng thuốc. Tách hai đồng phân của hợp chất này bằng phương pháp sắc ký là cực kỳ quan trọng để giữ cho thalidomide tốt không làm nhiễm bẩn phiên bản xấu.
Sắc ký khí là một trong những quá trình hóa học được sử dụng phổ biến nhất để tách chất lỏng, chất rắn và chất khí. Theo Linde Group, quy trình hoạt động bằng cách đưa hỗn hợp vào một dòng khí trơ. Các chất khác nhau được phân tách theo kích thước, sự tương tác với các phương tiện khác và sự hấp thụ vào máy dò hóa học.
