Một số yếu tố phi sinh học ở Sa mạc Sahara bao gồm đất, đặc điểm địa hình và nguồn nước sẵn có của nó. Yếu tố phi sinh học là những yếu tố không sống được trong hệ sinh thái hoặc môi trường sống, bao gồm các yếu tố khí tượng như nhiệt độ, vận tốc gió, độ ẩm và lượng mưa.
Sa mạc Sahara được nhiều người coi là một trong những môi trường khắc nghiệt nhất thế giới. Những cơn gió ở Sahara có thể đạt vận tốc như bão và là động lực tạo ra những cơn bão cát và quỷ bụi trong khu vực. Khoảng một nửa sa mạc nhận được lượng mưa ít hơn một inch hàng năm, trong khi nửa còn lại nhận được khoảng 4 inch. Khi trời mưa ở Sahara, mưa thường xối xả.
Với sự khác biệt là sa mạc nóng lớn nhất thế giới, Sahara là sa mạc tổng thể lớn thứ ba trên hành tinh và có diện tích đáng kinh ngạc 3,6 triệu dặm vuông. Trong tiếng Ả Rập, cái tên Sahara có nghĩa là "Sa mạc vĩ đại". Nó bao gồm các vùng của Tunisia, Sudan, Tây Sahara, Niger, Morocco, Mauritania, Mali, Libya, Ai Cập, Chad và Algeria.
Mặc dù Sahara có nhiều cồn cát, nhưng nó chủ yếu được tạo thành từ hamada đá, là những khu vực cao nguyên đá cứng. Có một số khu vực cồn cát dịch chuyển có thể đạt đến độ cao 590 feet. Nước ở Sahara chỉ giới hạn trong sông Nile và một số sông suối theo mùa hoặc bất thường.