Linnaeus đã dựa trên hệ thống phân loại ban đầu của mình về các cơ quan sinh sản của thực vật, theo lịch sử của Carl Linnaeus trên trang web của Bảo tàng Cổ sinh vật học của Đại học California. Lớp và thứ tự của thực vật được quyết định bởi nhị hoa (cơ quan nam) và nhụy hoa (cơ quan nữ). Thực vật không có xu hướng giới tính rõ ràng được gộp vào Nhóm Cryptogamia, hay còn được gọi là "thực vật có hôn nhân ẩn".
Cuối cùng Linnaeus đã phát triển một hệ thống phân loại các vật sống và vô tri theo thứ bậc, theo Education Portal. Hệ thống của ông đã đi từ danh mục rộng nhất đến danh mục cụ thể nhất theo thứ tự giảm dần. Bằng cách nghiên cứu hình thái, ngoại hình của một sinh vật, Linnaeus đã phân loại hơn 11.000 sinh vật. Trong khi khoa học hiện đại sử dụng phát sinh loài (các mối quan hệ tiến hóa) làm cơ sở để tổ chức, công trình của Linnaeus vẫn được coi là nền tảng của phân loại học.
Thuyết tiến hóa của Charles Darwin đã thay đổi cách các nhà khoa học phân loại các sinh vật sống. Trong khi các nhà sinh vật học đồng ý với Linnaeus trong việc xếp lợn, nhím và người vào chi Mammalia, họ làm điều đó vì những lý do khác nhau, theo Hiểu Tiến hóa từ Bảo tàng Cổ sinh vật học Đại học California. Trong khi Linnaeus tìm cách nhóm các loài theo ngoại hình, các nhà phân loại học hiện đại lại theo thuyết tiến hóa rằng cả ba loài đều có bốn chân và nuôi con non vì chúng có nguồn gốc từ một tổ tiên chung.