Hải cẩu tự bảo vệ mình khỏi những kẻ săn mồi bằng cách phóng qua mặt nước khi những kẻ săn mồi đe dọa chúng. Với thân hình thon gọn, đôi tai nhạy bén và chân chèo khỏe, hải cẩu có thể phát hiện ra kẻ săn mồi và bơi với tốc độ cao để thoát khỏi cuộc tấn công.
Hải cẩu cũng có những chiếc răng sắc nhọn và bộ hàm khỏe mạnh rất hữu ích khi chống lại những kẻ săn mồi. Do hải cẩu nuốt chửng con mồi mà không cần nhai nên răng của chúng chủ yếu được dùng để chống lại các loài hải cẩu khác để giành quyền thống trị. Chúng cũng có thể chém những kẻ săn mồi bằng những chiếc răng nanh lớn của mình để tự vệ. Hải cẩu voi là một trong những loài hải cẩu to nhất và có ít kẻ thù hơn hải cẩu thông thường. Cá mập trắng lớn và Orcas là kẻ thù của hải cẩu voi vì hai loài sinh vật biển này có hàm răng dài và sắc nhọn có thể xuyên qua lớp da dày của hải cẩu. Để tránh bị tấn công, hải cẩu voi phóng nhanh qua hoặc bơi sâu dưới nước. Những con hải cẩu khổng lồ này có thể bơi tới 12 dặm một giờ và lặn sâu tới 2.000 bộ.
Ngoài việc sử dụng tốc độ và hàm răng chắc khỏe, hải cẩu còn tự bảo vệ mình khỏi khí hậu lạnh giá khắc nghiệt của Nam Cực nhờ bộ lông dày của chúng, có nhiều lớp lớn màu hồng bên dưới. Áo khoác lông của chúng giữ không khí và thêm một lớp cách nhiệt, hoạt động tốt khi chúng nghỉ ngơi trên cạn. Hải cẩu tu sĩ Hawaii vốn sống ở vùng biển nhiệt đới, ấm áp nên không có khả năng thích nghi đặc biệt với khí hậu ấm áp. Họ chỉ cần tìm một nơi nghỉ ngơi râm mát và không hoạt động trong ngày nắng nóng.