Hải cẩu đàn hạc không phải là loài có nguy cơ tuyệt chủng, theo Scientific American. Tuy nhiên, các nhà khoa học và đồng nghiệp tại Đại học Duke và Quỹ Động vật hoang dã quốc tế đã xác định rằng sự giảm băng mùa đông tại các khu vực sinh sản của hải cẩu là một mối đe dọa đang diễn ra.
Các nhà khoa học đã quan sát thấy tốc độ tan chảy của băng mùa xuân, xảy ra từ tháng 2 đến tháng 3, đã tăng nhanh, theo báo cáo của Cục Thủy sản Biển Quốc gia, một bộ phận của Cục Quản lý Khí quyển và Đại dương Quốc gia (NOAA). Kể từ năm 2014, tình trạng này đã khiến hải cẩu mẹ không còn lớp băng dày để sinh và nuôi dưỡng đàn con. Thông thường, hải cẩu con có thời gian nuôi con kéo dài 12 ngày. Các nhà khoa học tiếp tục nghiên cứu ảnh hưởng của xu hướng ấm lên này đối với quần thể hải cẩu.
Các mối đe dọa khác đối với quần thể hải cẩu đàn hạc là nạn săn bắt của con người, các vụ đánh thuyền và ô nhiễm môi trường.
