Bọt biển biển sinh sản vô tính bằng cách nảy chồi và hữu tính bằng cách phóng thích các giao tử đực vào nước. Các giao tử này được các bọt biển khác tiếp nhận, sau đó tạo ra các giao tử đực cũng được thả vào nước. Sự chớm nở có thể là bên ngoài hoặc bên trong. Sự nảy chồi bên trong được dành riêng cho những điều kiện khắc nghiệt, trong đó con cái bên trong được bảo vệ khi bọt biển bố mẹ chết xung quanh nó.
Bọt biển có thể có giới tính riêng biệt hoặc cả hai, tùy thuộc vào loài. Bọt biển lấy tinh trùng từ nước giống như khi chúng làm thức ăn, sử dụng các tế bào cổ đặc biệt của chúng để hút nước và các hạt. Khi nhận được tinh trùng, các tế bào cổ áo sẽ mất cổ áo và chuyển sang dạng giống như amip. Sau đó, các tế bào này di chuyển để mang tinh trùng đến các tế bào trứng của bọt biển.
Bọt biển có tổ chức đơn giản nhất so với bất kỳ loài động vật nào, sở hữu các tế bào chuyên biệt nhưng không có mô hoặc cơ quan. Mỗi miếng bọt biển đều có một hệ thống lỗ chân lông và kênh để nước đi qua, được điều khiển bởi các tế bào trùng roi lót các kênh này. Các tế bào này được nâng đỡ bởi một khung collagen được củng cố bởi các spicules, được cấu tạo từ các hợp chất silic hoặc canxi, tùy thuộc vào loài. Các tế bào riêng lẻ bao bọc và tiêu hóa các thức ăn thay vì mang chúng đến bất kỳ vùng tiêu hóa trung tâm nào.
