Cổng xâm nhập phổ biến nhất của mầm bệnh là đường hô hấp. Tác nhân gây bệnh xâm nhập qua các hạt bụi hoặc giọt xâm nhập vào đường hô hấp. Một số mầm bệnh xâm nhập theo cách này là các loại vi rút được gọi là cúm, sởi và varicella-zoster, gây ra bệnh thủy đậu.
Người lớn trung bình có thể hít thở khoảng 21 feet khối không khí mỗi ngày, tạo ra nhiều cơ hội lây nhiễm bệnh. Virus lây nhiễm qua đường hô hấp bằng cách tự gắn vào tế bào và nhân lên. Một số bệnh nhiễm trùng phổ biến nhất ở khu vực này là cảm lạnh thông thường, viêm tiểu phế quản và viêm phổi.
Các cổng khác bao gồm da, đường tiêu hóa và đường sinh dục. Ví dụ về các bệnh nhiễm trùng bao gồm quai bị, uốn ván, sốt rét và AIDS.
