Việc sử dụng chính của axit photphoric là trong sản xuất phân bón, mặc dù nó cũng được sử dụng để sản xuất chất tẩy rửa tổng hợp. Các ứng dụng khác của axit photphoric bao gồm xử lý nước và kim loại, và đôi khi nó cũng được sử dụng như một chất phụ gia trong một số loại thực phẩm và đồ uống.
Axit photphoric được sử dụng như một chất phụ gia và hương liệu trong cả thức ăn cho người và gia súc. Nó thường được sử dụng trong sô-đa để cung cấp một hương vị chua hoặc sắc nét. Trên thực tế, hầu như tất cả hương vị axit trong soda đều đến từ axit photphoric, vì axit cacbonic có trong bong bóng ảnh hưởng rất ít đến độ pH tổng thể. Axit photphoric cũng giúp ngăn vi khuẩn và nấm hình thành trong những đồ uống có đường này.
Phốt pho là một trong những chất dinh dưỡng thực vật thiết yếu nhất. Để bổ sung thêm lượng phốt pho cho đất, axit photphoric được chuyển hóa thành phốt phát sau đó được trộn với các thành phần khác để tạo thành phân bón. Hơn 80% axit photphoric được sản xuất trên thế giới được sử dụng trong sản xuất phân bón. Tính đến năm 2014, châu Á là nhà sản xuất axit photphoric lớn nhất thế giới, với khoảng 14 triệu tấn được sản xuất mỗi năm. Bắc Mỹ đứng thứ hai về sản lượng, với sản lượng hàng năm khoảng 10 triệu tấn.
