Các vùng nước chính ở Mexico là Vịnh California (địa phương được gọi là Mar de Cortés), Vịnh Mexico, sông San Juan và Hồ Chapala (hồ nước ngọt lớn nhất). >
Vịnh California còn được gọi là Biển Cortez và Biển Vermilion. Nó được coi là một vùng nước chính vì nó ngăn cách bán đảo California với Mexico và có đường bờ biển dài 4.000 km. Vịnh Mexico rộng 1.500 km và giáp với Mexico, Cuba và các bang Texas, Louisiana, Mississippi, Alabama và Florida của Hoa Kỳ. Laka Chapala, hồ nước ngọt lớn nhất ở Mexico, nằm ở các thành phố tự trị Chapala, Jocotepec, Jamay, Jalisco và Poncitlan. Sông San Juan, một trong nhiều con sông trên toàn thế giới có tên này, được coi là một con sông lớn vì nó cung cấp nước cho bang Nuevo León.
Mặc dù đây là những vùng nước chính ở Mexico, quốc gia này cũng có một số hồ, ao, sông và vịnh nhỏ hơn. Thác Basaseachic trên sông Basaseachic là thác nước cao thứ hai ở Mexico, và thác Piedra Bolada là thác cao nhất. Rất nhiều sông và hồ ở Mexico được nông dân sử dụng hoặc là điểm thu hút khách du lịch nổi tiếng.
