Con người và rắn đều có hộp sọ, xương sống và xương sườn hỗ trợ và bảo vệ các cấu trúc mềm hơn trong cơ thể. Con người và rắn đều là hậu duệ của một tổ tiên chung nên có rất nhiều đặc điểm trên bộ xương của chúng tương tự với nhau, mặc dù đã được sửa đổi nhiều.
Con người và rắn đều có hộp sọ chứa não và hỗ trợ hầu hết các cơ quan giác quan của động vật, chẳng hạn như mắt và mũi. Cả hai đều có xương hàm, mặc dù hàm của động vật có vú rất đơn giản và hàm của bò sát là sự sắp xếp phức tạp của xương và sụn. Con người và rắn đều có răng, mặc dù số lượng và chủng loại của mỗi bộ khác nhau giữa các loài và thậm chí từ cá thể này sang cá thể khác.
Rắn và con người đều có các đốt sống cổ, lưng trên và lưng dưới có thể nhận dạng được, đồng thời các xương của cột sống cũng giống nhau về hình thức và chức năng. Cả hai loại xương này đều có dạng hình nhẫn, với các khoảng trống ở giữa để hỗ trợ sự di chuyển của tủy sống. Rắn thường có nhiều đốt sống hơn con người, và hầu hết các xương ở cột sống hỗ trợ một bộ xương sườn. Con người cũng có xương sườn, mặc dù số lượng ít hơn rắn, và tất cả đều được gắn vào xương của phần trên lưng. Một số loài rắn, chẳng hạn như boas, có cấu trúc tương tự như hông và chân sau, nhưng chúng là động vật có lông và bị giảm kích thước đáng kể.
