Trận Antietam, còn được gọi là Trận Sharpsburg, dẫn đến việc các lực lượng của Liên minh dưới quyền của Tướng phải rút lui khỏi bang Maryland trong cuộc xâm lược đầu tiên của ông vào lãnh thổ Liên minh. Mặc dù tổn thất của cả hai bên đều lớn đến mức đánh dấu ngày đẫm máu nhất trong lịch sử Hoa Kỳ, việc Lee buộc phải rút lui khỏi Maryland được coi là một chiến thắng của Liên minh và là bước ngoặt của cuộc chiến. Nắm bắt cơ hội do chiến thắng của Liên minh đã quá hạn từ lâu, Tổng thống Abraham Lincoln đã ban hành Tuyên bố Giải phóng 4 ngày sau đó.
Việc quân miền Nam rút lui khỏi lãnh thổ Liên minh sau Trận chiến Antietam đã chấm dứt hy vọng của miền Nam về việc Pháp hoặc Anh công nhận nền độc lập của họ. Cả hai quốc gia đều theo dõi chặt chẽ cuộc xâm lược của Lee đối với phương Bắc và có thể đã can thiệp thay mặt cho Liên minh miền Nam nếu cuộc xâm lược thành công.
Tướng George B. McClellan, chỉ huy lực lượng Liên minh trong trận Antietam, đã bị Tổng thống Lincoln cách chức chỉ huy chưa đầy 2 tháng sau đó vì không truy đuổi được quân thất bại của Tướng Lee khi họ rút vào lãnh thổ của Liên minh.
