Trong khi một số Cơ đốc nhân đã sử dụng màu sắc của cầu vồng để giải thích hoặc chiếm đoạt ý nghĩa từ các câu chuyện trong Kinh thánh, thì bản thân Kinh thánh không gán ý nghĩa cho màu sắc. Cầu vồng chỉ xuất hiện hai lần trong Kinh thánh, trong những cuốn sách đầu tiên và cuối cùng. Những người theo đạo Cơ đốc cảm thấy lần xuất hiện đầu tiên của nó trong câu chuyện về trận lụt là đặc biệt, bởi vì câu chuyện về trận lụt trong Kinh thánh là câu chuyện duy nhất có cầu vồng. Đức Chúa Trời đặt một cầu vồng trên bầu trời như một biểu tượng rằng những cơn mưa đã kết thúc và một trận lũ lụt với tỷ lệ như vậy sẽ không bao giờ xảy ra nữa.
Các lý thuyết của Cơ đốc giáo về ý nghĩa xa hơn của cầu vồng và màu sắc của nó chủ yếu tập trung vào nỗ lực trình bày mối tương quan giữa bảy màu của cầu vồng và bảy ngày hình thành. Cầu vồng cũng đã được sử dụng để vẽ các điểm tương đồng với ánh sáng, như sự sáng tạo đầu tiên của Đức Chúa Trời, và tất cả các màu sắc của trái đất, như là sự phản chiếu trong sự kết hợp khác nhau của các màu được thể hiện trong cầu vồng. Tốt nghiệp hơn nữa, điểm trở thành Thiên Chúa đã ban cho con người ánh sáng để cho chúng ta thấy rằng Ngài bao gồm tất cả mọi thứ. Cũng vì lý do này, cầu vồng đôi khi được dùng làm biểu tượng của Chúa Giê-su, người mà các tín đồ Cơ đốc tin rằng mọi điều đều có thể xảy ra.
Trong Kinh thánh, màu đỏ thường tượng trưng cho tội lỗi và huyết của Đấng Christ ban sự cứu chuộc. Kinh thánh cũng thảo luận về màu đỏ là màu của đau khổ trong các sách Xuất hành và Ê-sai. Ngược lại, màu cam thể hiện sự phán xét đối với hành động của con người, như các tác giả Kinh thánh đã thảo luận trong cả sách Thi thiên và sách Khải huyền. Đồ gốm trong Kinh thánh thường có màu cam và các nhân vật trong Kinh thánh thỉnh thoảng đập vỡ đồ gốm để bày tỏ sự ghê tởm trước hành vi của con người.
Màu vàng tượng trưng cho cuộc sống vĩnh cửu và vinh quang. Theo nhiều điểm trong Kinh thánh, ánh sáng màu vàng biểu thị sự tin kính và tình trạng thiêng liêng. Ngoài ra, trong sách Gióp, màu vàng tượng trưng cho sự cay đắng.
Màu tím trong Kinh thánh tượng trưng cho hoàng gia. Các vị vua trong Kinh thánh thường mặc trang phục màu mè. Ngoài ra, các thầy tế lễ thượng phẩm của Kinh thánh đã sử dụng màu tím cho Cổng của Đền tạm. Trong Kinh thánh, màu tím thường tượng trưng cho công lý của Đức Chúa Trời và kế hoạch của Ngài để mang lại công lý cho thế giới.
Nhìn chung, Đức Chúa Trời hiển thị màu sắc của cầu vồng vào cuối trận lụt tàn phá thế giới. Theo sách Ê-xê-chi-ên, màu sắc kết hợp tượng trưng cho quyền năng của Đức Chúa Trời. Khi Đức Chúa Trời cho Nô-ê thấy cầu vồng sau trận lụt, đó là dấu hiệu của Ngài cho thấy kế hoạch của Đức Chúa Trời là không bao giờ hủy diệt thế giới bằng một trận lụt nữa.