Thảm thực vật của Malaysia chủ yếu bao gồm rừng nhiệt đới đất thấp, rừng dưới núi và rừng trên núi, và rừng đầm lầy, vùng triều, nước ngọt và than bùn. Ngoài ra còn có những khu rừng giống như cây thạch nam trong đất cát rửa trôi và trên bờ biển.
Malaysia nằm trên đường xích đạo và nhận được lượng mưa lớn. Do đó, nhiệt độ cao quanh năm, là môi trường lý tưởng cho sự sống của thực vật phát triển. Sự đa dạng của đời sống thực vật ở Malaysia thuộc hàng cao nhất trên thế giới.
Các loài thực vật có mạch có số lượng lên đến hàng nghìn, chỉ riêng các loài cây đã lên tới hơn 2.000. Một số loài thực vật ngoạn mục nhất tồn tại ở Malaysia. Trong số đó có loài hoa lớn nhất được biết đến, hoa quái vật ký sinh, có đường kính gần 3 feet. Malaysia cũng là quê hương của nhiều loại cây nắp ấm ăn thịt.
Trong chưa đầy một nửa mẫu Anh, có thể tìm thấy một trăm loài cây khác nhau, cây bụi, cây leo và thực vật biểu sinh, những loài thực vật không ký sinh mọc trên các loài cây khác và ăn khí quyển.
Phần lớn rừng rậm đã bị phá hủy bởi hoạt động phá rừng nông nghiệp hoặc thương mại, gió bão khắc nghiệt và do người dân bản địa khai khẩn đất để làm nương rẫy. Khi đất bị khai phá bị bỏ hoang, cây bụi, đồng cỏ thô và rừng thứ sinh sẽ lấy lại đất.
