Các bào quan trong tế bào thường bao gồm nhân, ribosome, lưới nội chất, màng tế bào và thành tế bào. Ngoài ra còn có cytoskelteon, tế bào chất, bộ máy Golgi, lục lạp và ti thể; và cả không bào, túi và lysosome. Thực vật và tế bào động vật hơi khác nhau, với tế bào động vật không bao giờ chứa lục lạp hoặc thành tế bào.
Mỗi cơ quan trong một tế bào có một chức năng khác nhau. Hạt nhân là trung tâm hoạt động của tế bào và kiểm soát tất cả các chức năng khác. Ribosome tạo ra protein, và lưới nội chất là cơ quan vận chuyển vật chất qua tế bào. Màng tế bào duy trì cân bằng nội môi trong tế bào và cung cấp sự bảo vệ và hỗ trợ. Bộ xương tế bào chỉ đơn giản là bộ khung của tế bào và chức năng của tế bào chất là bảo vệ các bào quan khác.
Bộ máy Golgi hoạt động với lưới nội chất để cung cấp nguyên liệu chính xác cho các bào quan khác. Ti thể tổ chức quá trình được gọi là hô hấp tế bào. Quá trình này tạo ra ATP, là năng lượng mà tế bào cần để tồn tại. Lysosome tiêu hóa các phần tế bào già và chết, đồng thời phá vỡ các phân tử thành các mảnh nhỏ hơn. Không bào và túi chứa thức ăn trong tế bào.
Hầu hết các bào quan xuất hiện trong cả hai tế bào. Tuy nhiên, chỉ ở tế bào thực vật, thành tế bào cung cấp sự hỗ trợ và bảo vệ, còn lục lạp sử dụng ánh sáng mặt trời để tạo ra năng lượng dưới dạng thức ăn cho cây.
