Tên của các bệnh do động vật nguyên sinh gây ra bao gồm sốt rét, tiêu chảy, kiết lỵ và viêm đại tràng. Ở động vật, các sinh vật này có thể gây ra bệnh cầu trùng và bệnh toxoplasma. Các triệu chứng của nhiễm trùng đơn bào bao gồm buồn nôn, đau bụng và chướng bụng.
Động vật nguyên sinh sống trong ruột người có thể được truyền sang người khác qua đường phân-miệng, chẳng hạn như ăn phải thức ăn hoặc nước bị ô nhiễm. Động vật nguyên sinh trong máu và mô người có thể được truyền bởi một vector động vật chân đốt.
Động vật nguyên sinh là những sinh vật đơn bào quá nhỏ để có thể nhìn thấy bằng mắt thường và khả năng nhân lên rất nhanh ở người giúp tăng cường khả năng sống sót của chúng. Một số động vật nguyên sinh bao gồm Cryptosporidium parvum, Isospora belli và Balantidium coli.
