Tất cả các proton đều có cùng khối lượng; khối lượng của mỗi proton là 938,27 megaelectronvolts, hay 1,6726231 * 10 -27 kilogam. Trên thực tế, tất cả các proton đều giống nhau, cũng như tất cả các electron và tất cả neutron, mặc dù mỗi hạt trong số ba hạt hạ nguyên tử này là khác biệt với hai loại còn lại. Các proton và neutron có khối lượng gần như nhau, với các proton chỉ nặng hơn neutron một chút (1,6749286 * 10 -27 kg), nhưng các electron nhẹ hơn cả proton và neutron, có trọng lượng là 9.1093897 * 10 < sup> -31 kg.
Các proton, neutron và electron là các hạt hạ nguyên tử tạo nên tất cả các nguyên tử. Nguyên tử là cơ sở xây dựng của mọi thứ trong vũ trụ. Các proton và neutron tạo nên hạt nhân của nguyên tử; proton và neutron cung cấp phần lớn trọng lượng của nguyên tử, vì vậy phần lớn khối lượng của nguyên tử nằm trong hạt nhân, với đám mây electron mỏng bên ngoài cung cấp trọng lượng tương đối nhỏ.
Theo một đơn vị khối lượng khác, một proton là 1,007316 đơn vị khối lượng nguyên tử, trong khi một nơtron là 1,008701 đơn vị khối lượng nguyên tử. Vì Einstein đã chứng minh rằng khối lượng và năng lượng là như nhau (E = mc 2 ), các nhà khoa học có thể sử dụng một trong hai hoặc cả hai đơn vị năng lượng và đơn vị khối lượng để đo khối lượng của proton.