Hầu hết tất cả các loại virus đều quan trọng về mặt kinh tế và cho đến nay, có hai loại là quan trọng nhất. Đầu tiên, vi rút côn trùng có thể được sử dụng như các hình thức kiểm soát dịch hại để bảo vệ các loại cây màu. Thứ hai, vi rút lây lan ở người có thể ảnh hưởng lớn đến sản lượng kinh tế của khu vực bị ảnh hưởng.
Các dạng vi rút côn trùng phổ biến được gọi là baculovirus đã trở nên phổ biến trong kho vũ khí kiểm soát dịch hại của nông dân hiện đại. Các chủng virus này có khả năng lây nhiễm trên 600 loài côn trùng khác nhau. Thông qua việc sử dụng loại vi rút này như một loại thuốc chống côn trùng, nông dân có thể tiết kiệm hàng trăm nghìn đô la mỗi năm mà không để cây trồng tiếp xúc với các hóa chất độc hại có trong thuốc trừ sâu.
Mặt khác, vi rút ở người, đặc biệt là vi rút dẫn đến tử vong, có thể gây ra những hậu quả kinh tế tiêu cực lớn. Ví dụ, vi rút Ebola ở châu Phi đã gây ra thiệt hại kinh tế hơn 1,6 tỷ đô la, làm tê liệt các nền kinh tế quốc gia của Guinea, Sierre Leone và Liberia. Tương tự như vậy, Tổ chức Y tế Thế giới dự đoán rằng vi rút HIV /AIDS có thể trừ 1% tổng sản phẩm quốc nội mỗi năm ở một số lượng lớn các quốc gia châu Phi cận Sahara. Tuy nhiên, ở Nam Phi, Tổ chức Y tế Thế giới nghi ngờ tổn thất do vi rút HIV /AIDS lan tràn có thể trừ 17% tổng sản phẩm quốc nội của đất nước mỗi năm.
