Nhiều loài nguyên sinh quan trọng đối với con người vì chúng là những nhà sản xuất chính ở đáy của kim tự tháp thực phẩm, biến năng lượng từ mặt trời thành dạng có thể truyền từ sinh vật này sang sinh vật khác lên kim tự tháp thực phẩm. < /strong> Các vi sinh vật cũng ổn định nồng độ ion trong nước, cho phép rong biển và cá, cả hai đều là nguồn thức ăn quan trọng cho con người, phát triển mạnh.
Sinh vật nguyên sinh chủ yếu là sinh vật đơn bào; một số loài giống thực vật hơn, và một số loài khác giống động vật hơn. Tảo cát là một loại nguyên sinh thực vật sống chủ yếu ở nước ngọt. Hiện diện với số lượng khổng lồ, chúng đóng vai trò là cơ sở của chuỗi thức ăn trong các môi trường sống nước ngọt này, cung cấp năng lượng thông qua quá trình quang hợp. Nếu không có tảo cát, các loài động vật lớn hơn như cá và trai mà con người cho ăn, sẽ không có mặt. Một loại protist giống thực vật khác là tảo đỏ, sống trong môi trường biển và tạo ra thạch, môi trường được sử dụng làm cơ sở để nuôi cấy vi khuẩn trong các phòng thí nghiệm trên khắp thế giới. Các đĩa thạch đã được sử dụng trong các thí nghiệm ở tất cả các phương pháp nghiên cứu y học. Tảo nâu, một ví dụ về sinh vật nguyên sinh đa bào hiếm gặp, phục vụ trực tiếp như một nguồn thực phẩm ở một số vùng ven biển và cũng được sử dụng như một nguồn iốt để bổ sung và phân bón.