John Hagee đã viết trong một lá thư năm 1975 cho giáo đoàn của mình rằng anh ta phạm tội vô luân, sau đó anh ta ly dị vợ mình, Martha Downing. Sự vô luân chính xác vẫn chưa được biết. Anh kết hôn với Diana Castro, một thành viên trong hội thánh của anh, vào ngày 12 tháng 4 năm 1976. Việc tái hôn ngay sau khi ly hôn đã dẫn đến những cáo buộc rằng anh đã ngoại tình trong cuộc hôn nhân của mình.
Hagee kết hôn với Downing vào năm 1960 và cặp đôi có với nhau hai mặt con. Hagee là mục sư tại Nhà thờ Trinity ở San Antonio, nhưng những lời chỉ trích từ vụ ly hôn khiến ông từ chức.
Hagee có ba người con với Castro, tên là Matthew, Christina và Sandy. Hagee và các con của ông với Castro cũng là nhạc sĩ, những người đã cùng nhau biểu diễn The Hagees.
Vào ngày 11 tháng 5 năm 1975, Hagee khởi công một nhà thờ mới, được gọi là Nhà thờ ở Castle Hills. Mặc dù chỉ có 25 thành viên để bắt đầu, nhưng nó đã nhanh chóng phát triển về quy mô, dẫn đến hai lần mở rộng. Đầu tiên là khu bảo tồn với 1.600 chỗ ngồi, và khu thứ hai là khu bảo tồn với 5.000 chỗ ngồi. Hagee đặt tên là Nhà thờ Cornerstone tôn nghiêm thứ hai. Con trai của ông, Matthew, sau đó đã tiếp quản vị trí mục sư điều hành của nhà thờ.
Hagee đã viết sách và nhiều đài truyền hình tôn giáo đã phát các bài giảng của ông. Ông cũng đã thành lập các tổ chức tôn giáo.
