Giao thức Kênh Bảo mật (SCP) chủ yếu được sử dụng để truyền tệp giữa máy chủ từ xa và máy chủ cục bộ hoặc hai máy chủ cục bộ, trong khi Giao thức truyền tệp bảo mật (SFTP) cho phép nhiều hoạt động hơn trong quá trình truyền tệp qua mạng. Ngoài việc truyền tệp, SFTP có thể được sử dụng cho các tác vụ như tiếp tục quá trình truyền bị gián đoạn, xóa tệp từ xa và liệt kê nội dung của thư mục.
Dựa trên giao thức mạng Secure Shell (SSH), SCP được thiết kế để cung cấp các kênh được mã hóa để truyền dữ liệu an toàn giữa các máy chủ khác nhau. SCP sử dụng Lớp vỏ Bảo mật (SSH) cho cả quá trình chuyển và xác thực, nhằm đảm bảo tính bí mật trong quá trình vận chuyển.
SFTP được thiết kế như một phần mở rộng cải tiến của SSH. Ngoài việc cung cấp các kênh liên lạc được mã hóa giữa các máy tính, nó còn cung cấp nhiều chức năng và khả năng truyền tệp hơn so với SCP. SFTP cũng độc lập với nền tảng hơn Giao thức kênh bảo mật. Một sai lầm phổ biến mà nhiều người mắc phải là xem SFTP là một dạng an toàn hơn của giao thức FTP tiêu chuẩn. Điều này là không đúng. SFTP là một giao thức khác độc lập với FTP và không tương thích với các máy chủ FTP. Một điểm khác biệt chính giữa cả hai giao thức là SCP chỉ hoạt động trên các máy chủ chạy SSH phiên bản 1, trong khi SFTP chỉ hoạt động với các máy chủ chạy SSH phiên bản 2.