Nhược điểm của kỹ thuật thả treo bao gồm khả năng bỏ sót một vài tế bào chuyển động trong số vô số tế bào không di động và quá trình quan sát có thể tốn thời gian. Kỹ thuật thả treo là một phương pháp được sử dụng để kiểm tra các vi sinh vật sống.
Có những nhược điểm khác khi sử dụng phương pháp thả treo. Nó không phải là một phương pháp an toàn để sử dụng khi một người đang đối phó với các sinh vật cực kỳ gây bệnh, vì con người có thể dễ dàng bị nhiễm trùng. Việc thiết lập thiết bị cần thiết cho kỹ thuật thả treo cần có thời gian và các slide khoang được sử dụng rất tốn kém. Các nắp đậy, là một phần của thiết bị, khá mỏng manh và việc xử lý chúng có thể gây ra thách thức.
Một phương pháp khác được sử dụng để quan sát các sinh vật nhỏ bé là kỹ thuật gắn ướt. Sự khác biệt giữa hai phương pháp này là kỹ thuật treo ướt khô nhanh hơn so với phương pháp treo thả. Vì phương pháp thả treo không khô nhanh nên nó cho phép kiểm tra vi sinh vật lâu hơn và quan sát đáng tin cậy hơn. Phương pháp thứ ba để kiểm tra khả năng vận động của sinh vật là kiểm tra nhu động bán rắn.
Kỹ thuật thả treo cũng được sử dụng trong quá trình kết tinh protein, là quá trình hình thành tinh thể protein.
