Nhược điểm của thụ tinh bên ngoài bao gồm phụ thuộc vào nước và lượng lớn tinh trùng và trứng bị lãng phí không bao giờ đạt được giao tử tương ứng, ngay cả khi các sinh vật phóng thích trứng và tinh trùng ở gần nhau. Ngoài ra , những quả trứng được giải phóng có thể không có vỏ, vì chúng sẽ ngăn chặn tinh trùng.
Thụ tinh bên ngoài chỉ được sử dụng bởi những động vật sinh sản dưới nước, vì tinh trùng cần nước để bơi qua để gặp trứng. Động vật sử dụng chiến lược sinh sản này bao gồm hầu hết các loài cá, hầu hết các loài lưỡng cư và nhiều loại động vật không xương sống dưới nước khác. Do sự thụ tinh không chắc chắn của bất kỳ trứng cụ thể nào, động vật sử dụng phương pháp thụ tinh ngoài thường tạo ra số lượng rất lớn tinh trùng và trứng.
Phương pháp thụ tinh ngoài cũng có những ưu điểm hơn so với thụ tinh trong. Trong quá trình thụ tinh bên trong, một con đực của một loài trực tiếp đưa tinh trùng vào một con cái, sau đó tinh trùng này bơi trong chất lỏng xung quanh đường sinh sản để đến gặp trứng. Đây là chiến lược thường được sử dụng bởi các loài động vật sinh sản trên cạn. Mặc dù đây là một phương pháp đáng tin cậy hơn về khả năng mỗi trứng được thụ tinh, nhưng nó lại phức tạp hơn phương pháp thụ tinh bên ngoài. Nó đòi hỏi sự phối hợp chặt chẽ giữa nam và nữ về hành vi và sinh lý, đòi hỏi sự kiểm soát nội tiết tố sâu rộng.