Nhiều loài chim, bò sát, động vật lưỡng cư và động vật có vú trong rừng nhiệt đới đang có nguy cơ tuyệt chủng. Chúng bao gồm những loài động vật quen thuộc, chẳng hạn như tinh tinh ở Trung Phi và những động vật tương đối ít được biết đến, chẳng hạn như ếch voi của Australia.
Các loài chim rừng nhiệt đới có nguy cơ tuyệt chủng bao gồm vẹt đuôi dài và vẹt đuôi dài Lear ở Nam Mỹ và vẹt mào vàng của Indonesia. Sự tàn phá môi trường sống là một vấn đề nghiêm trọng đối với nhiều loài chim này, nhưng một số loài trong số chúng, đặc biệt là vẹt đuôi dài lục bình, cũng đã bị suy giảm dân số do bị thu gom để buôn bán vật nuôi.
Các quần thể lưỡng cư trên toàn thế giới đã giảm trong vài năm. Cả ếch phi tiêu độc vàng và bọ ngựa vàng đều là những loài lưỡng cư có nguy cơ tuyệt chủng ở tầng rừng nhiệt đới. Nguyên nhân của sự suy giảm động vật lưỡng cư không rõ ràng trong mọi trường hợp và có thể bắt nguồn từ sự kết hợp của sự tàn phá môi trường sống, nấm, biến đổi khí hậu và thu hái.
Các loài động vật có vú như tê giác Java và hổ Sumatra đang đứng trước nguy cơ tuyệt chủng. Cả hai đều bị săn lùng vì các đặc tính y học có chủ đích, nhưng chúng cũng phải đối mặt với môi trường sống ngày càng bị chia cắt. Con lười ba ngón có móng và con lười ba ngón lùn là hai loài động vật khác đang biến mất khỏi môi trường sống trong rừng mưa nhiệt đới của chúng.
