Cơ sở dữ liệu có xu hướng đắt tiền và yêu cầu bảo trì liên tục, điều này gây tốn kém, chúng có thể cực kỳ phức tạp và khó hiểu đối với người dùng không hiểu hệ thống và nếu người dùng không biết cách bảo vệ thông tin của họ đúng cách, cơ sở dữ liệu có thể được sử dụng để truy cập thông tin đã được phân loại và dễ bị nhiễm vi-rút hoặc thư rác. Với bất kỳ cơ sở dữ liệu nào, người dùng phải biết cách điều hướng thông tin và thông tin nhạy cảm phải được bảo mật để kẻ xấu không thể truy cập.
Cơ sở dữ liệu chỉ đơn giản là một tập hợp có tổ chức các lượng lớn dữ liệu trên máy tính. Cơ sở dữ liệu được sử dụng trong một loạt các ứng dụng và chúng có thể là công khai hoặc riêng tư, trên internet hoặc trong máy chủ của một công ty. Việc thiết lập cơ sở dữ liệu cho một công ty có thể tốn kém và hầu hết các công ty cần thuê một giám đốc công nghệ thông tin để duy trì tất cả các cơ sở dữ liệu và đảm bảo rằng mọi người đều có thể lấy được thông tin của họ. Cơ sở dữ liệu có thể rất dễ vận hành, nhưng một số cơ sở dữ liệu rất phức tạp và đòi hỏi người dùng phải hiểu rất rõ về hệ thống trước khi truy cập dữ liệu.
Cơ sở dữ liệu cũng có nguy cơ bảo mật. Các công ty hoặc cá nhân có thể có thông tin nhạy cảm hoặc được phân loại trên cơ sở dữ liệu. Các công ty hoặc cá nhân đó cần biết cách bảo mật thông tin của họ, nếu không, dữ liệu có thể bị một bên không mong muốn truy cập, gây nguy hiểm tiềm tàng cho cá nhân hoặc công ty.