Tương tác với môi trường của con người đã ảnh hưởng đến sông Nile, là nguồn tài nguyên quan trọng nhất của Ai Cập, thông qua ô nhiễm công nghiệp và con người, bằng cách ngăn chặn lũ lụt của sông vào mùa hè và thông qua việc đưa một loài cá mới vào sông. < /strong> Trong suốt hơn 100 năm, tác động của con người lên sông Nile đã ảnh hưởng tiêu cực đến cuộc sống của những người dân sống gần nó cũng như cảnh quan xung quanh nó. Việc xây dựng Đập cao Aswan vào năm 1899, đưa cá rô sông Nile ăn thịt vào sông và sự gia tăng các chất ô nhiễm, chẳng hạn như nitơ, phốt pho và các loại thuốc trừ sâu khác, tất cả đã góp phần vào những thay đổi đáng kể trong môi trường của Ai Cập.
Trước khi xây dựng Đập cao Aswan, lũ lụt hàng năm của sông Nile đã để lại trầm tích trên các cánh đồng xung quanh nó. Những trầm tích này đã góp phần tạo nên độ phì nhiêu của đất. Các lớp trầm tích hiện đang bị giữ lại bởi con đập và sự bồi đắp của chúng ở thượng nguồn cũng đã làm cho tình trạng xói mòn bờ biển ngày càng gia tăng. Dựa trên ước tính năm 2005, bờ biển của Ai Cập đang bị xói mòn với tốc độ từ 410 đến 574 feet mỗi năm. Con đập này cũng ngăn chặn các chất dinh dưỡng chảy ra biển Địa Trung Hải qua sông Nile. Đây được cho là một trong những nguyên nhân làm giảm đáng kể số lượng cá cung cấp cho ngư dân thương mại trong khu vực.
Vào giữa những năm 1900, loài cá rô sông Nile đã được đưa vào hệ sinh thái sông với nỗ lực cải thiện sản lượng đánh bắt. Mặc dù ban đầu, phần giới thiệu được nhìn nhận một cách lạc quan, nhưng loài ăn thịt này đã sớm nuốt chửng một lượng lớn các loài bản địa, khiến dân số giảm đi đáng kể và trong một số trường hợp là tuyệt chủng.
