Theo Hiệp hội Vi sinh học Hoa Kỳ, chất khử trùng hoạt động bằng cách thay đổi độ pH của môi trường vi khuẩn, làm cho môi trường có thể sinh sống được. Vì vi sinh vật thích nghi với môi trường của chúng, chất khử trùng phải hoạt động nhanh chóng để tiêu diệt vi khuẩn trước khi nó có cơ hội thích nghi.
Cơ thể có thể chống lại hầu hết các loại vi khuẩn một cách tự nhiên. Trên thực tế, việc tiếp xúc với vi khuẩn sẽ giúp cơ thể hình thành sức đề kháng để chống lại nó. Các nghiên cứu chỉ ra rằng việc sử dụng thuốc kháng sinh, thuốc sát trùng và các sản phẩm diệt vi trùng khác đối với trẻ em là yếu tố góp phần mạnh mẽ vào sự phát triển của bệnh dị ứng sau này trong cuộc sống.
Theo Trung tâm Kiểm soát và Phòng ngừa Dịch bệnh, một trong những mối quan tâm lớn nhất trong lĩnh vực y tế là một nhóm vi sinh vật hình thành khả năng kháng thuốc sát trùng và kháng sinh. Do tốc độ đột biến và thời gian sinh sôi nảy nở nhanh chóng, người ta lo ngại rằng một đàn vi khuẩn rất nhỏ có khả năng kháng thuốc sát trùng và kháng sinh có khả năng trở thành một đàn lớn nhanh chóng. Những vi khuẩn như vậy có khả năng làm phát sinh một dạng mầm bệnh mới có khả năng kháng thuốc tự nhiên đối với y học hiện đại. Điều này hoạt động giống như một người chỉ dùng một nửa số thuốc kháng sinh của mình, làm phát sinh thứ mà các nhà khoa học và bác sĩ gọi là siêu vi khuẩn, đã phát triển khả năng kháng lại thuốc kháng sinh.