Có một số phương pháp để xác định chủ đề của một câu chuyện ngắn, bao gồm đọc tiêu đề và chú ý các mô hình và biểu tượng lặp lại trong suốt câu chuyện. Chủ đề của một câu chuyện không bao giờ giải thích hoàn toàn ý nghĩa của nó; thay vào đó, nó chỉ hướng đến ý tưởng quan trọng nhất hoặc niềm tin kiểm soát.
Theo Đại học Yale, chủ đề chính của truyện ngắn thường phát triển thông qua xung đột mà nhân vật chính trải qua. Chủ đề, cốt truyện và cấu trúc đều đi đôi với nhau, vì vậy sẽ rất hữu ích nếu người đọc có thể xác định được tất cả các phần chính và hỏi và trả lời các câu hỏi về các chi tiết và cụ thể trong câu chuyện.