Hướng dẫn sử dụng chính thức cho iPhone 5s có sẵn dưới dạng PDF từ trang web Hỗ trợ của Apple. Hướng dẫn sử dụng cần thiết tùy thuộc vào hệ điều hành được cài đặt trên điện thoại.
Bạn cũng có thể đọc miễn phí hướng dẫn sử dụng trên thiết bị di động của mình thông qua iBooks, đi kèm với iOS 8 trở lên.
iPhone 5S ban đầu được cung cấp với hệ điều hành của Apple, iOS 7, được phát hành vào ngày 20 tháng 9 năm 2013. Hệ điều hành này có thể nâng cấp để sử dụng iOS 8.4, phát hành vào ngày 30 tháng 6 năm 2015 hoặc iOS 9.0, phát hành ngày 16 tháng 9 , 2015. Hướng dẫn sử dụng cho từng hệ điều hành này được tìm thấy trên trang web Hỗ trợ của Apple.
