Hệ thống quản lý tệp của máy tính cho phép người dùng phân loại và sắp xếp các tệp dữ liệu, thường theo phân cấp phân nhánh của các thư mục và thư mục con. Nhiều hệ thống cũng bao gồm các tính năng tìm kiếm và các công cụ khác cho phép hệ điều hành quản lý tệp bất kể chúng nằm ở đâu trong hệ thống tệp.
Trong một hệ thống quản lý tệp thông thường, các thư mục được sắp xếp trong một thư mục chính hoặc thư mục trên mỗi ổ đĩa. Ví dụ: thư mục "Ảnh" có thể được sử dụng để lưu trữ ảnh tĩnh, với các thư mục con được thiết kế để lưu trữ ảnh về các đối tượng khác nhau, chẳng hạn như các thành viên trong gia đình hoặc phong cảnh. Mặc dù hầu hết các hệ điều hành đều cung cấp một số hướng dẫn cơ bản về cách tạo và tổ chức các thư mục này, nhưng người dùng có thể thiết lập cấu trúc thư mục đơn giản hoặc phức tạp tùy thích.
Hệ thống thư mục là một hệ thống kế thừa, dựa trên hệ thống thư mục và thư mục con được tìm thấy trong máy tính cá nhân của những năm 1980. Các hệ điều hành hiện đại thường có các cách bổ sung để lập danh mục và phân loại tệp, chẳng hạn như thêm tất cả ảnh vào một bộ sưu tập duy nhất có thể được tìm kiếm và truy cập mà không cần điều hướng thủ công đến từng thư mục riêng lẻ. Một số hệ điều hành cũng cho phép người dùng điều hướng và tìm kiếm tệp bằng các tác nhân kỹ thuật số phản hồi lệnh thoại, chẳng hạn như Cortana của Microsoft.