Cua huỳnh đế hay còn gọi là cua hoàng đế Alaska, cấu tạo giải phẫu chủ yếu bao gồm mai, chân, móng và mai. Một số đặc điểm nhỏ hơn nhưng vẫn quan trọng bao gồm gai, đầu và khớp của chân. Cua vua khác về mặt giải phẫu so với hầu hết các loài cua khác ở chỗ chúng chỉ có sáu chân chứ không phải tám.
Màu sắc của vỏ ngoài cua hoàng đế phụ thuộc vào từng loài con chính xác và có thể thay đổi từ màu nâu đỏ sẫm đến màu xanh lam đến màu vàng. Cua xanh thường mảnh mai hơn và hình bầu dục hơn, nhưng tất cả cua hoàng đế đều phải lột vỏ để phát triển lớn hơn. Phần lớn nhất của cua huỳnh đế là phần giữa hay còn gọi là mai, từ đó đầu, chân và móng nhô ra.
Cua hoàng đế có hai móng, cái bên phải được coi là móng của gà thịt. Giải phẫu chân bao gồm bốn phần thiết yếu, với phần vai gần nhất với mai, phần đệm là phần trung tâm kết thúc ở khớp bản lề, phần chân và sau đó là phần đầu, thường có màu sẫm hơn và sắc nét ở phần cuối. Toàn bộ thân và chân cũng được đính những nốt gai nhỏ gọi là gai, giúp khả năng phòng thủ của cua hoàng đế trong tự nhiên trở nên ghê gớm hơn.
