Có nhiều loại động vật sống ở Ai Cập, bao gồm cả động vật đã được thuần hóa như trâu, lạc đà, cừu và dê cũng như mèo rừng, linh dương, cầy mangut và nhiều loài bò sát, lưỡng cư và chim. Địa hình, địa lý và khí hậu rất khác nhau trên khắp Ai Cập, và các điều kiện địa phương lần lượt xác định loại thực vật và động vật tồn tại ở một số địa điểm nhất định. Động vật thuần hóa được tìm thấy chủ yếu ở các trang trại dọc theo các con sông ở Ai Cập trong khi các động vật khác sống ở núi, sa mạc và đồng bằng.
Các loài động vật ở Ai Cập sống dưới nước cũng như trên cạn. Các sinh vật sống dưới nước bao gồm hà mã, một số loại rắn nước, cá, ếch và một số loại thằn lằn. Có một số loại rắn độc ở Ai Cập, bao gồm nhiều loài rắn hổ mang và rắn hổ mang Ai Cập, chúng cư trú ở các khu vực nông nghiệp màu mỡ ở các thung lũng sông Nile.
Cá sấu và cá sấu chúa cũng được tìm thấy ở sông và suối trong khi các loài động vật khác, chẳng hạn như bọ cạp, linh dương Dorac và các loài gặm nhấm nhỏ thích sống ở vùng Tây Sa mạc khô và nóng. Động vật hoang dã lớn nhất ở Ai Cập là aoudad, là một loại cừu cũng cư trú ở Sa mạc phía Tây, cùng với chó rừng Ai Cập, Fennec và Nubian ibex. Những loài khác, chẳng hạn như hyrax, sống cao ở vùng núi Sinai.
