Có nhiều loại động vật sống gần hoặc trên sông Nile, bao gồm cá sấu sông Nile, hà mã, tê giác, thằn lằn, cá rô, cá da trơn, ibis mỏ đỏ và chim bói cá. Con vật đồng nghĩa nhất với sông Nile Rive có thể là cá sấu sông Nile.
Loài bò sát này, lớn nhất ở châu Phi, có thể đạt chiều dài tối đa 20 feet và nặng khoảng 1.650 pound. Tuổi thọ của nó là gần 45 năm.
Từ xa xưa, hà mã đã sống gần con sông này. Mặc dù loài động vật này có nguy cơ tuyệt chủng, một số ít vẫn có thể đến thăm con sông.
Hai loài động vật khác có liên quan đến sông Nile là thằn lằn theo dõi sông Nile và cá rô sông Nile. Trong khi thằn lằn theo dõi có thể dài 7 feet, cá rô sông Nile là loài cá nước ngọt có thể đạt chiều dài tối đa 6 1/2 feet.
