Sử thi Gilgamesh có một số chủ đề đạo đức, nhưng chủ đề chính là tình yêu là động lực thúc đẩy. Các chủ đề đạo đức khác trong sử thi này là sự không thể tránh khỏi của cái chết và sự nguy hiểm khi giao dịch với các vị thần .
Tình yêu trong tình bạn của Enkidu và Gilgamesh đã truyền cảm hứng để cả hai trở thành những người đàn ông tốt hơn theo những cách khác nhau. Gilgamesh đã có thể kéo Enkidu ra khỏi lối sống tự cho mình là trung tâm và truyền cảm hứng cho Enkidu trở thành quý tộc. Đổi lại, Enkidu kiểm tra sự bồn chồn của Gilgamesh và thúc đẩy Gilgamesh ngăn chặn sự bắt nạt và bạo ngược của anh ta, cho phép anh ta trở thành một anh hùng và một vị vua tốt hơn. Mối quan hệ của họ cho phép Gilgamesh tiếp xúc với nhu cầu của mọi người.
Việc thiếu vắng sự quan tâm của một phụ nữ lãng mạn trong sử thi này không có nghĩa là tình yêu khiêu dâm không đóng vai trò gì. Sự giáo dục của Enkidu bắt đầu từ việc bắt đầu quan hệ tình dục của anh ta bởi một gái điếm trong đền thờ. Đây là những gì bắt đầu rắc rối của hai anh hùng, vì nó trùng hợp với việc họ không chấp thuận Ishtar, nữ thần tình yêu. Chỉ khi Gilgamesh hiểu rằng vị trí của mình là trên trái đất, Ishtar mới trở lại vị trí danh dự của mình.
Một bài học tuyệt vời khác mà Gilgamesh học được là sự thật không thể chối cãi về cái chết của con người. Anh căm phẫn sự bất tử của các vị thần, và khi Enkidu chết một cái chết đau đớn, Gilgamesh càng kinh hãi hơn khi nghĩ đến cái chết của chính mình. Nhiệm vụ thứ hai của anh ấy là Utnapishtim, một nỗ lực để thoát khỏi cái chết, dạy anh ấy rằng mặc dù con người chết, nhân loại vẫn sống tiếp.
Cả Gilgamesh và Enkidu đều biết rằng các vị thần rất nguy hiểm để đối phó, vì chúng có thể hành xử theo cảm xúc và phi lý trí. Qua trận lụt lớn, họ biết rằng con người không thể hiểu được hành động của các vị thần. Ở Mesopotamia, lòng mộ đạo và sự tôn trọng đối với các vị thần không phải là nghĩa vụ mà là sự thừa nhận thực tế về sức mạnh của tự nhiên và là lời nhắc nhở về vai trò của con người trong kế hoạch lớn hơn của mọi thứ.
