Cấu trúc liên kết màng có chứa các enzym tiêu hóa là lysosome. Lysosome chứa các enzym phân hủy các đại phân tử hữu cơ như carbohydrate, chất béo và protein. Tất cả các tế bào động vật đều chứa lysosome, nhưng chúng hiện diện nhiều nhất trong các tế bào của hệ thống miễn dịch, chẳng hạn như tế bào bạch cầu.
Khoảng 40 loại enzym tiêu hóa khác nhau nằm bên trong lysosome. Các enzym này được tạo ra bởi các bào quan được gọi là ribosome, được gắn vào lưới nội chất và được các cơ quan Golgi đưa vào các gói. Bên trong hoặc chất nền của lysosome có độ pH axit khoảng 4,8, là môi trường tối ưu cho các enzym. Bên ngoài lysosome, các enzyme này trở nên vô hại vì độ pH ở đó không có tính axit và không hỗ trợ hoạt động bình thường của các enzyme lysosome.