Các thuộc địa hoàng gia được quản lý bởi chế độ quân chủ Anh thông qua một thống đốc hoàng gia do chế độ quân chủ bổ nhiệm cũng như hội đồng hoàng gia. Thống đốc và hội đồng được hỗ trợ bởi các hội đồng cấp dưới mà họ giám sát.
Nhiều thuộc địa hoàng gia đã không bắt đầu được quản lý theo cách này. Thay vào đó, họ thường là sở hữu độc quyền hoặc liên doanh do chế độ quân chủ Anh cấp. Tuy nhiên, khi các điều lệ này hoặc đến thời hạn hoặc bị chế độ quân chủ thu hồi, các thuộc địa chuyển đổi thành thuộc địa của hoàng gia. Những người theo chủ nghĩa thực dân lo ngại về sự không ổn định trong cách quản lý của họ, vì các thống đốc độc quyền có thể thay đổi hoặc thậm chí bị những người thuộc địa phế truất trước khi chuyển đổi sang thuộc địa hoàng gia, thậm chí còn mang lại nhiều thay đổi hơn.
Thống đốc của một thuộc địa hoàng gia được bổ nhiệm bởi nhà vua và thực hiện các mong muốn của nhà vua hơn là mong muốn của riêng thống đốc. Các chỉ thị của hoàng gia có hai dạng: một ủy ban chung, được đọc to khi thống đốc được bổ nhiệm, về cơ bản là kiến thức công khai và các chỉ thị đặc biệt thường chỉ được đọc bởi chính thống đốc.
Trong các thuộc địa, thống đốc là cơ quan tư pháp cao nhất, được chế độ quân chủ khuyến khích sử dụng quyền phủ quyết của mình để thúc đẩy lợi ích của Anh bất cứ khi nào có thể. Thống đốc, hội đồng hoàng gia của ông và các thành viên chính thức khác của chính phủ thuộc địa hoàng gia thường được chọn do mối quan hệ xã hội và chính trị của họ thay vì kinh nghiệm hoặc khả năng cai trị người khác.
