Mặc dù cá và bò sát có chung một số đặc điểm, nhưng cá không phải là loài bò sát. Sự khác biệt quan trọng nhất giữa hai nhóm động vật là cá sử dụng mang để thở, trong khi bò sát sử dụng phổi.
Cá và bò sát đều là động vật có xương sống, có nghĩa là chúng có xương sống và hầu hết các loài đều máu lạnh. Bò sát sống trên cạn và dưới nước, trong khi cá sống hoàn toàn dưới nước. Ngoài ra, tất cả các loài bò sát đều có vảy, nhưng chỉ một số loài cá có vảy. Các loài bò sát bao gồm cá sấu, rắn, thằn lằn và rùa biển. Cá bao gồm cá có xương, chẳng hạn như cá hồi và cá hồi; cá sụn, chẳng hạn như cá mập và cá trượt băng; và đèn ngủ và cá mập.