Trang chủ PubMed cung cấp thông tin về số lượng trích dẫn mà nó có, cũng như các ví dụ về các loại tài liệu mà nó cung cấp và thực thể mà tài liệu được thu thập. Dưới tiêu đề Sử dụng PubMed là các liên kết đến hướng dẫn bắt đầu nhanh, các bài báo đầy đủ, câu hỏi thường gặp, hướng dẫn và công cụ tìm kiếm thử nghiệm lâm sàng. Thông tin bổ sung trên trang chủ bao gồm địa chỉ của Trung tâm Thông tin Công nghệ Sinh học Quốc gia, Thư viện Y khoa Quốc gia Hoa Kỳ.
Dưới tiêu đề Công cụ PubMed là các liên kết có tên PubMed Mobile, Trình đối sánh trích dẫn đơn lẻ, Trình đối sánh trích dẫn hàng loạt, Truy vấn lâm sàng và Truy vấn theo chủ đề cụ thể. Tiêu đề Tài nguyên khác cung cấp các liên kết đến cơ sở dữ liệu MeSH, tạp chí cơ sở dữ liệu NCBI, các chương trình Tiện ích lập trình Entrez và LinkOut.
Tiêu đề Bắt đầu ở cuối trang chủ là các liên kết đến Trung tâm Quốc gia về Thông tin Công nghệ Sinh học, sách hướng dẫn trợ giúp NCBI và sổ tay NCBI. Liên kết đến đào tạo và tài liệu hướng dẫn cũng có sẵn, cũng như liên kết để gửi dữ liệu.
Trong tiêu đề Tài nguyên, người dùng tìm thấy các liên kết có tên Hóa chất & xét nghiệm sinh học, Dữ liệu & Phần mềm, DNA & RNA, Tên miền & Cấu trúc và Gen & Biểu thức. Di truyền & Y học, Bộ gen & Bản đồ, Bản đồ học, Văn học và Protein là những liên kết bổ sung.
Trang chủ PubMed cung cấp một liên kết để viết bàn trợ giúp ở gần dưới cùng bên phải. Một liên kết liên hệ nằm ở dưới cùng bên trái.