Hệ thống nhận dạng ký tự mực từ tính cung cấp mức độ bảo mật cao vì các ký tự MICR được viết bằng mực oxit sắt và tuân theo một định dạng nghiêm ngặt, điều này khiến nó hầu như không thể giả mạo; tuy nhiên, các hệ thống chuyên dụng này rất tốn kém và chỉ có thể được sử dụng để đọc các phông chữ MICR được viết ở các định dạng cụ thể. Các hộp mực được sử dụng trong máy in MICR cũng đắt hơn so với các hộp mực khác.
Một ưu điểm chính khác của nhận dạng ký tự mực từ tính là nó có tỷ lệ lỗi đọc nhỏ. Máy quét MICR được phát triển để giải mã chính xác các ký tự, miễn là chúng tuân theo các tiêu chuẩn được thiết lập bởi Hiệp hội Ngân hàng Hoa Kỳ, ABA và Viện Tiêu chuẩn Quốc gia Hoa Kỳ, ANSI.
Các tiêu chuẩn này khá cao và có thể khó đạt được, điều này có thể là một bất lợi rõ rệt đối với một số tổ chức. ANSI quản lý và thực hiện tất cả các tiêu chuẩn in ấn; nếu phông chữ MICR không đáp ứng các tiêu chuẩn đã đặt ra, chúng sẽ gây ra lỗi xử lý và bị từ chối tại các ngân hàng và các tổ chức khác.
Công nghệ nhận dạng ký tự mực từ tính hầu hết được các ngân hàng sử dụng để xác minh tính hợp lệ của séc; một số hãng hàng không sử dụng chúng để xác nhận vé máy bay. Các ký tự và số thường được tìm thấy ở cuối séc. Máy in laser sử dụng mực in MICR được sử dụng để in các ký tự mực từ tính.