Ở Hy Lạp, tôn giáo chính là Chính thống giáo Hy Lạp. Mặc dù chính phủ Hy Lạp không giữ số liệu thống kê chính thức về tôn giáo, United Stated ước tính rằng nhánh Cơ đốc giáo này chiếm khoảng 98% cư dân Hy Lạp.
Hồi giáo là tôn giáo phổ biến thứ hai ở Hy Lạp. Một nhóm người Hồi giáo sống ở Thrace. Chiếm khoảng 1,3% dân số, cộng đồng 150.000 người này được hưởng quy chế chính thức là một dân tộc thiểu số theo đạo Hồi theo Hiệp ước Lausanne năm 1923, hiệp ước chấm dứt các cuộc chiến giữa các cường quốc Đồng minh và Thổ Nhĩ Kỳ sau Thế chiến I. Theo Bộ Ngoại giao Hoa Kỳ, ước tính có khoảng 500.000 đến 700.000 người Hồi giáo từ Trung Đông, Trung Á và Bắc Phi sống ở khu vực xung quanh Athens. Các cộng đồng nhỏ của các tôn giáo khác, bao gồm Khoa học giáo, Công giáo La Mã, Nhân chứng Giê-hô-va và Đạo Do Thái đã bao quanh cộng đồng tôn giáo của Hy Lạp.
