Theo ước tính năm 2012 của chính phủ Hoa Kỳ, tôn giáo chính ở Ai Cập là Hồi giáo. Khoảng 90 phần trăm cư dân Ai Cập là người Hồi giáo dòng Sunni.
Người Hồi giáo dòng Shia chiếm khoảng 1% dân số. Phần lớn trong số 9 phần trăm còn lại ở Ai Cập xác định là Cơ đốc nhân, nhưng họ thuộc nhiều giáo phái khác nhau. Phần lớn người theo đạo Thiên chúa ở Ai Cập thuộc về Nhà thờ Chính thống Coptic trong khi phần còn lại thuộc về Công giáo La Mã, Maronite, Armenia Apostolic, Chính thống giáo và Anh giáo. Một cộng đồng nhỏ theo đạo Tin lành cũng tồn tại. Chỉ có khoảng 70 người Do Thái ở Ai Cập, và hầu hết trong số họ là người cao tuổi. Theo một nghiên cứu được thực hiện bởi Cơ quan Thống kê và Huy động Công chúng Trung ương vào năm 2011, cả nước có 108.395 nhà thờ Hồi giáo và 2.869 nhà thờ, những con số này không bao gồm các cuộc tụ tập không chính thức trong nhà dân.
