Vị trí tuyệt đối của Tokyo, Nhật Bản ở vĩ độ 35 độ 41 phút về phía bắc và kinh độ 139 độ 41 phút về phía đông. Tokyo nằm xung quanh phần trung tâm của quần đảo Nhật Bản, phía nam của huyện Kanto ở Honshu, hòn đảo chính của đất nước.
Tokyo có chung ranh giới với 4 quận hành chính, đó là tỉnh Saitama, tỉnh Chiba, tỉnh Yamanashi và tỉnh Kanagawa. Tokyo, Chiba, Kanagawa và Saitama bao gồm Vùng Megalopolis Tokyo, với thêm bốn tỉnh khác là Gunma, Yamanashi, Ibaraki và Tochigi tạo thành Vùng thủ đô quốc gia. Tokyo vẫn là trung tâm công nghệ và thương mại ở vùng Kanto của Nhật Bản.
