Thỏ San Juan là những con thỏ đã sống trên quần đảo San Juan. Những con thỏ này được cho là đã du nhập từ châu Âu đến quần đảo San Juan vào khoảng giữa năm 1875 và 1895. Những con thỏ có nguồn gốc từ những con thỏ bị bắt trên quần đảo San Juan còn được gọi là thỏ San Juan.
Những con thỏ cung cấp nguồn thức ăn cho cáo bản địa nhưng ngược lại chúng đã phá hoại rất nhiều hệ sinh thái cũng như các loài động thực vật bản địa của quần đảo San Juan. Quần đảo San Juan nằm ngoài khơi bờ biển của bang Washington và được coi là một phần của bang đó.