Chuột máy tính được đặt tên như vậy vì nó giống với loài gặm nhấm cùng tên. Thân của thiết bị giống với thân tròn của động vật, với dây giống như đuôi dài của chuột. Chuột được Douglas Engelbart phát minh vào năm 1964, và trong khi một thành viên trong nhóm của ông nghĩ ra cái tên này, không ai nhớ chính xác người đầu tiên gọi thiết bị này là chuột.
Engelbart lần đầu tiên hình dung ra con chuột máy tính vào năm 1961 trong khi xem xét các khả năng của planimeter, một công cụ kỹ thuật dùng để đo khoảng cách. Thiết kế ban đầu của ông sử dụng hai bánh xe gắn ở góc vuông để đo trục X và Y riêng biệt. Thật không may, điều này gây khó khăn cho việc theo dõi chuyển động theo đường chéo, một vấn đề đã được sửa chữa vào năm 1972 khi đồng đội của Engelbart là Bill English phát triển con chuột bi đầu tiên.
Ban đầu, chuột là một phần của tập hợp các thiết bị đầu vào. Nhóm nghiên cứu đã phát triển một thiết bị dựa trên các phím điện báo có năm nút, được sắp xếp giống như các phím của đàn piano. Khi người dùng chuyển sang sử dụng chuột để nhập đồ họa, các phím này có thể được sử dụng cho các chức năng bổ sung. Thiết bị bổ sung chưa bao giờ cất cánh bên ngoài phòng thí nghiệm, chuột và bàn phím đã trở thành thiết bị nhập liệu tiêu chuẩn của máy tính.